Samudera Indonesia mendirikan unit bisnis yang bergerak di bidang depo peti kemas pada tahun 1992. Layanan yang diberikan oleh unit bisnis ini meliputi layanan utama seperti penanganan peti kemas untuk proses lift off/lift on, penyimpanan peti kemas kosong, pemeliharaan dan perbaikan, pembersihan, trucking, layanan reefer, dan garment on hanger. Selain itu, terdapat juga layanan seperti portacamp, penjualan unit peti kemas, penyewaan peti kemas dan lapangan penumpukan kargo peti kemas, serta penyewaan generator untuk peti kemas jenis reefer.

Unit bisnis ini memiliki 8 cabang yang didukung dengan lokasi strategis dan operasional 24 jam. Unit bisnis ini dilengkapi dengan surveyor yang memiliki Sertifikat IICL dan  sistem teknologi informasi yang memadai dengan fitur pelaporan setiap hari, pengiriman CODECO dan EDI secara otomatis dan sistem daring yang bisa diakses oleh pelanggan. CCTV juga memberikan nilai tambah bagi keamanan operasional di depo peti kemas.